Trong một bể cá cảnh biển có rất nhiều yếu tố dẫn đến sự thay đổi màu sắc của san hô. Tuy nhiên yếu tố cơ bản nhất dẫn đến sự thay đổi mầu sắc một cách độc đáo này chính là nguồn ánh sáng.
Chúng ta biết rằng san hô phản ứng với ánh sáng bằng cách điều chỉnh số lượng của các tế bào quang học, chúng đảm bảo trong việc sử dụng ánh sáng của San hô, cũng như các sắc tố bảo vệ khỏi ánh sáng mạnh ảnh hưởng xấu tới San hô. Khi San hô tiếp xúc với ánh sáng chiếu vào cơ thể chúng sẽ tìm cách thích ứng bằng cách cân bằng số lượng các tế và và sắc tố phù hợp với nhu cầu của chúng. Những yếu tố ảnh hưởng trực tiếp này bao gồm: Cường độ ánh sáng, phổ ánh sáng, tia UV.
Cường độ ánh sáng
Ánh sáng tác động đến san hô với những cường độ khác nhau.. Mỗi loài San hô lại thích ứng với những cường độ ánh sáng khác nhau. Ví dụ, một số loài san hô phát quang chúng có các tế bào đặc biệt, nhạy cảm ánh sáng được gọi là tế bào zooxanthellae. Những tế bào cộng sinh có chứa chất diệp lục và cung cấp chất dinh dưỡng cho san hô để đổi lấy San hô sẽ là lớp bọc bảo vệ chúng. Để đảm bảo một nguồn liên tục của các chất dinh dưỡng cần thiết, san hô chủ động kiểm soát số lượng tế bào zooxanthellae và lượng chất diệp lục trong các tế bào. Một trong những tiêu chí cơ bản cho các tế bào zooxanthellae và điều tiết chất diệp lục là cường độ ánh sáng.
Nếu ánh sáng cường độ cao hơn so với những mà san hô đang sống trong môi trường đó sẽ dẫn đến hai khả năng sau hoặc một số tế bào zooxanthellae sẽ bị trục xuất từ san hô hoặc lượng chất diệp lục trong các tế bào sẽ bị giảm đi.
Một số trường hợp các tế bào zooxanthellae dư thừa trong môi trường cường độ ánh sáng quá mạnh có thể sẽ gây nguy hiểm đối với san hô. Bởi lẽ dưới ánh sáng cường độ cao, oxy được tạo ra như một sản phẩm phụ của zooxanthellae có thể tích lũy với nồng độ độc hại trong san hô.
Ngược lại, nếu cường độ ánh sáng thấp hơn so nhu cầu của San hô, các tế bào quang zooxanthellae sẽ không thể sản xuất đủ lượng chất dinh dưỡng cho san hô . Sau đó, số lượng tế bào zooxanthellae, cũng như lượng chất diệp lục trong các tế bào, sẽ tăng lên để thu năng lượng ánh sáng nhiều hơn.
Vì vậy, làm thế nào tế bào zooxanthellae và nồng độ chất diệp lục ảnh hưởng đến màu san hô? Những tế bào này trong phạm vi màu từ màu vàng đến nâu và số lượng lớn các tế bào cung cấp cho các san hô sẽ xuất hiện màu nâu. Nói cách khác, cường độ ánh sáng làm thay đổi màu sắc của san hô quang do ảnh hưởng đến nồng độ của cả hai tế bào zooxanthellae và lượng chất diệp lục có mặt trong các tế bào. Vì vậy, trong điều kiện ánh sáng thấp, san hô sẽ xuất hiện màu nâu sẫm từ các rạn san hô trong các tế bào zooxanthellae hơn để sản xuất nhiều chất dinh dưỡng. Nếu san hô cùng được đặt dưới ánh sáng cường độ cao, các tế bào zooxanthellae sẽ bị loại bỏ và giảm lượng chất diệp lục sẽ cung cấp cho các san hô.
Thay đổi màu sắc do phổ ánh sáng
Phổ ánh sáng được dùng để chiếu sáng bể cá cảnh cũng sẽ làm thay đổi sự xuất hiện của các loài san hô. Thiết bị chiếu sáng khác nhau với bóng đèn quang phổ khác nhau truyền đạt khác nhau hiệu ứng màu sắc trên san hô. Ví dụ, bóng đèn phát ra ánh sáng mạnh trong khoảng màu xanh tím bạn có màu huỳnh quang rực rỡ, tuy nhiên bạn không thể nhìn thấy dưới ánh sáng ban ngày.
Tuy nhiên mỗi người lại có sở thích kết hợp các phổ ánh sáng khác nhau. Thông thương 1 rạn san hô sẽ kết hợp 1 bóng đèn với phổ là 50% ánh sáng trắng và 50% còn lại là màu xanh, ánh sáng tím
Thay đổi màu sắc do ánh sáng UV
Trong tự nhiên, sóng ánh sáng cực tím (UV-A và UV-B) thâm nhập vào bề mặt của đại dương nhưng được lọc ra khi ánh sáng đi qua bề mặt nước. Cả hai tia UV-A và UV-B với sóng ánh sáng đã được tìm thấy có thể gây hủy hoại DNA và RNA trong mô của san hô. Đổi lại khá nhiều loài san hô có thể thích nghi để giảm tác động của các tia có hại. Những rặng san hô phát triển sắc tố bảo vệ mà thường là màu xanh, tím, hoặc màu hồng. Hầu hết các loài san hô có chứa những sắc tố đến từ vùng nước nông, nơi số lượng UV-A và UV-B ánh sáng là cao hơn so với các vùng sâu hơn có chứa các rạn san hô.
Trong bể cá cảnh đôi khi san hô sẽ thay đổi mầu sắc. Nó không có gì đặc biệt hay nguy hại cả. Đôi khi chỉ là sự thích nghi với cường độ ánh sáng, quang phổ và ánh sáng tia cực tím